浩瀚無垠的太空是人類的共同財富，開發和利用太空資源是人類的共同追求。1992年我國實施的載人航天工程，是中央立足世界科技革命迅猛發展的時代背景，為推動我國科技進步和創新、提升我國綜合國力作出的一項重大戰略決策。也是20世紀50年代以來，我國探索、開發和利用宇宙空間的重要實踐之一。
20余年來，我國載人航天事業取得了舉世矚目的輝煌成就，作為載人航天工程重要組成部分——空間科學與應用，其深度、廣度在不斷拓展，在國家整體發展戰略中的地位與作用也日益突出，對人類文明和社會進步的影響也進一步增強。
2010年11月，中國科學院黨組決定在空間科學與應用總體部（1993年成立）的基礎上籌建中國科學院空間應用工程與技術中心（以下簡稱中心），2012年8月，中央機構編制委員會批準成立中心。中心代表中國科學院負責載人航天等重大科技工程空間應用系統方面的總體管理和技術集成，具體包括空間科學及應用戰略研究、空間應用任務組織實施、總體技術支持支撐、科學成果產出及推廣等工作，同時對我院承擔的載人航天工程各大系統協助配套任務進行協助管理。
作為擁有20余年大型航天工程建設、管理經驗的新建國家科研單元，中心（總體部）堅持以載人航天工程任務為主線，利用神舟系列飛船、交會對接空間實驗室平臺開展了50余項空間科學和應用研究，研制的500余臺/套有效載荷圓滿完成了歷次飛行試驗任務。在對地觀測及地球環境監測、空間生命科學與生物技術、空間材料科學、微重力流體物理、空間天文探測、空間環境探測、應用新技術等領域取得了一大批具有重大價值的科學與應用成果。
當前，我國載人航天工程已基本完成“三步走”戰略中的第二步，載人空間站研制任務全面啟動。空間站階段預計實施空間科學及應用任務幾百余項，研制、裝載有效載荷數千余臺/套，空間站將成為推動我國空間科學跨越發展的歷史機遇與重要途徑。新的征程，中心將以“率先行動”計劃為統攬，以“一三五”規劃為抓手，著力強化戰略引領、著力推進平臺建設、著力夯實能力基礎、著力加強人才引進與儲備、著力優化資源配置、著力深化交流合作，圓滿完成載人空間站應用工程任務，力爭取得重大突破、整體跨越，通切實將中心建設成為國內一流、國際著名的空間總體機構。
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